第一关 凯驾驶的神古移动到加血基地芬妮驾驶希奥尼。格恩的亚克托助攻，这关只注意用阿尔帮忙加血，至于洛克，温妮，一开始很弱，如不想被击坠，可以移动到神古上面搭载！准备杀吉伯的时候，用1级的我方去杀它，可直接升到16级！斗结束卡尔加入。
卡尔驾驶的鬼斯很弱，用完精神后可以三振出局躲在母舰上了，这一关尽快用芬妮和凯消灭小兵，然后再慢慢干掉 诺曼和杰克。战斗结束后，洛克离去。
这关等尼娜下来后用凯劝降尼娜，5回合希拉驾驶拉英增援，然后杀所有小兵再打刚达R即可。
第二关的盖塔Q（过关后留队），第三关的妮娜（第七关结束后离队）第六关的麦乔（第八关离开）、第八关的米巴X（第十关离开）、第十关萨米（十三关结束后离开）、十四关米亚（十五关叛变）、十六关珍妮（劝降后不再攻击，但不加入），25关珍妮（再次劝降，过关后离开）、十七关伊娃（直到最后）、22关普西（直到最后）伊娃和普西只能二选一，其他我方正常加入的人员都会跟到最后。
第7关：（第二关一关要记得不要杀盖塔Q）
第24关，先干掉奇恩再杀吉尔
第25关，先杀围在希亚旁边的四个机器人再杀希亚
第26关，用安东一次性杀 留乃，休，洛克，罗纳，奇恩
用主角机、泰坦（过关时资金+3W）、G7(过关时出战全员PP+10）、神、命运、阿姆罗、刹那、阿鲁特、激励哥、大红莲、断空我、真盖塔、魔神Z、超重神、创圣、六神。
还有可出击位子就加点补给修理机。OP的话没加速技能的上+移动的（或者+移动的全部装在船上，第一回合跑的慢的全部上船开过去），射程短的+射程的，地形适应差的+适应的。
第二次超级机器人大战技巧：
1、大家先可以向下方进军，以确保敌人的远程攻击攻击，与此同时我们可以反击，其他的敌人只要用牛高很快就可以解决，还有要确保修理机的存活和精神的节制。
2、打两个BOSS都可以利用牛高达的射程与他们相同，从而他们不会攻击修理机，这样慢慢磨他们就行了，打吉尔时消灭他后他会变身，所以要节约精神。第六回合敌增援2枚核弹。过关后普露换乘新机体。
